《雕菰樓經(jīng)學(xué)九種》，由《周易補(bǔ)疏》二卷、《尚書補(bǔ)疏》（《尚書孔氏傳補(bǔ)疏》）二卷、《毛詩補(bǔ)疏》五卷、《禮記補(bǔ)疏》（《禮記鄭氏注補(bǔ)疏》）三卷、《春秋左傳補(bǔ)疏》（《左氏春秋傳杜氏集解補(bǔ)疏》）五卷、《論語補(bǔ)疏》（《論語何氏集解補(bǔ)疏》）三卷、《孟子正義》三十卷、《禹貢鄭注釋》二卷、《群經(jīng)宮室圖》二卷等九種書組成，共五十四卷。現(xiàn)將上述“九種”的主要版本情況筒述如下：
收錄于清嘉慶、道光年間刊刻的《焦氏叢書》本。
收錄于清光緒二年（一八七六）衡陽魏氏重刊的《焦氏遺書》本。
收錄于清道光五年（一八二五）阮元刊刻的《皇清經(jīng)解》本。
收錄于清咸豐十年（一八六〇）勞崇光刊刻的《皇清經(jīng)解》補(bǔ)刊本（南菁書院本）。
收錄于清光緒十四年（一八八八）王先謙刊刻的《皇清經(jīng)解續(xù)編》本。
收錄于臺灣文海出版社據(jù)清嘉慶間手稿影印的《雕菰樓經(jīng)學(xué)叢書》本。
《雕菰樓經(jīng)學(xué)九種》中，《禹貢鄭注釋》的稿本，現(xiàn)藏天津市圖書館。《群經(jīng)官室圖》又有半九書塾刻本，昊鼎、李慈銘跋，現(xiàn)藏國家圖書館。孫誥讓批校本，現(xiàn)藏溫州市圖書館�！睹献诱x》的稿本，現(xiàn)藏國家圖書館。又清道光刻本，謝章鍵校，現(xiàn)藏福建省圖書館。又世界書局《諸子集成本》，存十四卷。中華書局據(jù)學(xué)海堂經(jīng)解排印本�！睹献友a(bǔ)疏》二卷，稿本現(xiàn)藏國家圖書館等等。
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